筑波大學位于東京東北部60公里處的茨城縣土浦市，北依筑波山，東臨霞浦湖，風景十分優(yōu)美。這里原是一片荒地，現(xiàn)今是日本嶄新的大學科學城，筑城大學就位于這座科學城的中心。筑波大學沒有圍墻，盡管周圍各種建筑鱗次櫛比，但筑波校區(qū)內(nèi)各建筑物之間仍留有“豐富”的空間，配有人工湖和綠草地點。主校區(qū)在筑波，依北一南的走向分為北、中、南、西四塊。其中中塊為教學區(qū)，主要的學群和少量學系均在這里；南塊為研究區(qū)，大部分學系、研究中心設(shè)在這里；西塊為醫(yī)學區(qū)域，西塊和北段為學校師生食宿設(shè)施區(qū)域。主校區(qū)占地246。5萬平方米。此外，在東京文京區(qū)、大冢等地分校區(qū)亦有一些占地，主要為一些附屬學校及少數(shù)研究中心所在地。目前筑波大學有10所附屬學校：附屬小學、附屬高中、附屬大冢養(yǎng)護學校、附屬桐加丘養(yǎng)護學校。
筑波大學的重大改革之一是：改革以往傳統(tǒng)的教學研究組織管理體制，按適應(yīng)社會的新型大學要求來設(shè)立教學和研究機構(gòu)。日本的大學教學和研究組織機構(gòu)，一般都是按學部、講座形式設(shè)置，對外封閉，對內(nèi)分散割據(jù)，不能適應(yīng)新時代學科不斷分化和綜合的要求。因此，筑波大學改變“過去的大學往往陷于狹隘的專門領(lǐng)域，造成教育和研究兩個方面趨于停滯和固定化，以致脫離現(xiàn)實社會”的傾向，提出取消教學研究合一的學部、講座制，而設(shè)置二者分開的學群（學類）、學系制。
第一學群為基礎(chǔ)學群，擔任全校基礎(chǔ)課的教學，下分3個學類：人文學類、包含哲學、史學、考古和民俗學、語言學等專業(yè)學科；社會科學學類。包含社會學、法學、政治學、經(jīng)濟學等；自然科學類，包含數(shù)學、物理學、化學、地球科學。
第二學群為文化·生物學群，這是跨學科的學群，下分5個學類：比較文化學類（含有比較文學、地域文化學、現(xiàn)代思想學），日本語言文化學類（僅有日本語言和日本文化一專業(yè)方向），人際學類（有教育學、心理學、心身障礙學），生物學類（含基礎(chǔ)生物學、應(yīng)用生物學兩大部門），農(nóng)林學類（有水產(chǎn)生物資源、生態(tài)環(huán)境、生物應(yīng)用化學、生物水產(chǎn)組織等）。
第三學群為經(jīng)營·工程學群，這是新的構(gòu)想和尖端科學組成的學群，下分5個學類：社會工程學類，含有社會經(jīng)濟、經(jīng)營工程、城市規(guī)劃等；國際關(guān)系學類；信息學類，有信息科學、信息工程；系統(tǒng)工程學類，含有知識工程系統(tǒng)和操作工程系統(tǒng)；基礎(chǔ)工程學類，含有物理工程、材料和分子工程、轉(zhuǎn)換工程、構(gòu)造工程等。
醫(yī)學專業(yè)學群，含醫(yī)學、新醫(yī)學；
體育專業(yè)學群，有體育學、運動學、健康體質(zhì)學；
藝術(shù)專業(yè)學群，有藝術(shù)學、美術(shù)、構(gòu)思創(chuàng)作和設(shè)計等。
筑波大學的研究生院分成碩士課程和博士課程兩類要求不同的教學部門，下設(shè)研究所，前者為8個，后者為19個。
碩士課程的研究科有：教育研究科含有障礙兒童教育、教育科學教育、咨詢3專業(yè)方向；經(jīng)營·政策科學研究科含經(jīng)營·政策科學、系統(tǒng)經(jīng)營科學、企業(yè)法等；體育科學研究科含體育方法學、教練學、健康教育學等；藝術(shù)研究科含美術(shù)和設(shè)計兩個專業(yè)方向；還有地域研究科、理工科研究科、環(huán)境科學研究科和醫(yī)學研究科。
大學院（研究生院）專業(yè)設(shè)置
博士課程研究科有：哲學·思想研究（哲學、倫理、宗教）、歷史·人類學（史學、文化人類學）、文藝·語言研究（文學、外國文學、語言學）、教育學（教育基礎(chǔ)、學校教育）、心理學、心身障礙學、社會科學（法學、經(jīng)濟學、社會學）、社會工程（計量計劃、經(jīng)營工程、城市地區(qū)規(guī)劃）、國際政治經(jīng)濟學、生物學（生物、生物物理化學）、數(shù)學、物理、化學、地球科學（地理水文、地質(zhì)）、工程學（物理工程、材料工程、結(jié)構(gòu)工程、電子信息工程）、醫(yī)學（形態(tài)學、生理、生化、生物、環(huán)境生態(tài)）、體育學、藝術(shù)學。
研究組織與教學組織分開，有學系、特別課題組和研究中心3種組織機構(gòu)。
學系
基本上以學科劃分，劃分原則為：學系不能太狹窄，盡可能地在相鄰學科領(lǐng)域中相互溝通，教員要能適應(yīng)全學系的研究，而且要向一定的學群和研究生院的研究科擔任教學任務(wù)，現(xiàn)共有26個學系：哲學·思想學、歷史·人類學、文藝·語言學、現(xiàn)代語言文學、教育學、心理學、心身障礙學、社會科學、社會工程、生物科學、農(nóng)村科學、農(nóng)林工程、應(yīng)用生物化學、數(shù)學、物理、化學、地球科學、物理工程、材料工程、結(jié)構(gòu)工程、電子·信息工程、體育科學、藝術(shù)科學、基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、社會醫(yī)學。
特別課題組
根據(jù)學術(shù)研究發(fā)展和社會需要設(shè)立，是跨學系的大型綜合、學科交叉的組織，不僅吸收校內(nèi)有關(guān)學系的教員，還向國內(nèi)外招收客員教授。特別課題組不是固定不變的組織機構(gòu)，在一定時期（一般為5年）內(nèi)當任務(wù)完成后即行解散，再根據(jù)新的研究課題而重新組織新的特別課題組，目前有3個課題組：①新國際系統(tǒng)研究課課組，研究課題有全球政治、經(jīng)濟有全球政治、經(jīng)濟、安全保障等；亞洲、太平洋區(qū)域政治、經(jīng)濟、安全保障；國際大系統(tǒng)的形成與日本的作用。②代謝研究課題組，課題有細胞間信息傳遞問題研究；生物體代謝可見性有關(guān)問題；循環(huán)代謝的異同研究。③循環(huán)器官的生物系統(tǒng)課題組，課題有：未知生物機能因子及其機能，生物機能因子與其受體的細胞內(nèi)信息傳遞，生物機能因子的循環(huán)防治機制及其異同，由遺傳因子導入的生物機能因子的解析等。
國民體質(zhì)研究，原子核特性特征，拉丁美洲研究，運動方法研究，熱帶農(nóng)村資源，生物體老化研究，生物本能的研究，物質(zhì)進化研究，變換技術(shù)開發(fā)等9個課題組因研究任務(wù)完成而解散。
為鼓勵個人研究、數(shù)人聯(lián)合的共同研究、特別是鼓勵青年研究人員的研究熱情，學校決定重點投資，設(shè)立研究經(jīng)費基金，促進派進學校學術(shù)研究的開展。從1989年開始設(shè)立特別贊助研究項目以來，獲得了國際上的高度評價。至今，各種資助項目的申請有822件，采納了374件，資助的經(jīng)費已達27932萬日元。
目前，全校共有20個服務(wù)于教師、學生教學和科研的大型中心組織，它們是：計算物理學、外語、體育、農(nóng)林技術(shù)、教學器械、加速器、低溫、學術(shù)信息處理、放射性同位素、分析、工作、水文物理實驗、動物實驗、下田臨海實驗、菅平高原實驗、天體研究、留學生、遺傳實驗、大學研究、質(zhì)子線醫(yī)學利用研究。另有理療科教師培訓機構(gòu)。
筑波大學的重大改革之一是：改革以往傳統(tǒng)的教學研究組織管理體制，按適應(yīng)社會的新型大學要求來設(shè)立教學和研究機構(gòu)。日本的大學教學和研究組織機構(gòu)，一般都是按學部、講座形式設(shè)置，對外封閉，對內(nèi)分散割據(jù)，不能適應(yīng)新時代學科不斷分化和綜合的要求。因此，筑波大學改變“過去的大學往往陷于狹隘的專門領(lǐng)域，造成教育和研究兩個方面趨于停滯和固定化，以致脫離現(xiàn)實社會”的傾向，提出取消教學研究合一的學部、講座制，而設(shè)置二者分開的學群（學類）、學系制。
第一學群為基礎(chǔ)學群，擔任全校基礎(chǔ)課的教學，下分3個學類：人文學類、包含哲學、史學、考古和民俗學、語言學等專業(yè)學科；社會科學學類。包含社會學、法學、政治學、經(jīng)濟學等；自然科學類，包含數(shù)學、物理學、化學、地球科學。
第二學群為文化·生物學群，這是跨學科的學群，下分5個學類：比較文化學類（含有比較文學、地域文化學、現(xiàn)代思想學），日本語言文化學類（僅有日本語言和日本文化一專業(yè)方向），人際學類（有教育學、心理學、心身障礙學），生物學類（含基礎(chǔ)生物學、應(yīng)用生物學兩大部門），農(nóng)林學類（有水產(chǎn)生物資源、生態(tài)環(huán)境、生物應(yīng)用化學、生物水產(chǎn)組織等）。
第三學群為經(jīng)營·工程學群，這是新的構(gòu)想和尖端科學組成的學群，下分5個學類：社會工程學類，含有社會經(jīng)濟、經(jīng)營工程、城市規(guī)劃等；國際關(guān)系學類；信息學類，有信息科學、信息工程；系統(tǒng)工程學類，含有知識工程系統(tǒng)和操作工程系統(tǒng)；基礎(chǔ)工程學類，含有物理工程、材料和分子工程、轉(zhuǎn)換工程、構(gòu)造工程等。
醫(yī)學專業(yè)學群，含醫(yī)學、新醫(yī)學；
體育專業(yè)學群，有體育學、運動學、健康體質(zhì)學；
藝術(shù)專業(yè)學群，有藝術(shù)學、美術(shù)、構(gòu)思創(chuàng)作和設(shè)計等。
筑波大學的研究生院分成碩士課程和博士課程兩類要求不同的教學部門，下設(shè)研究所，前者為8個，后者為19個。
碩士課程的研究科有：教育研究科含有障礙兒童教育、教育科學教育、咨詢3專業(yè)方向；經(jīng)營·政策科學研究科含經(jīng)營·政策科學、系統(tǒng)經(jīng)營科學、企業(yè)法等；體育科學研究科含體育方法學、教練學、健康教育學等；藝術(shù)研究科含美術(shù)和設(shè)計兩個專業(yè)方向；還有地域研究科、理工科研究科、環(huán)境科學研究科和醫(yī)學研究科。
大學院（研究生院）專業(yè)設(shè)置
| 研究科 | 專業(yè)設(shè)置 |
| 教育研究科 | 學校領(lǐng)導能力開發(fā)、教科教育、特別支援教育 |
| 人文社會科學研究科 | 現(xiàn)代語·現(xiàn)代文化、國際公共政策、經(jīng)濟學、法學、國際地域研究 |
| 數(shù)理物質(zhì)科學研究科 | 數(shù)學、物理學、化學、物質(zhì)創(chuàng)成尖端科學、電子·物理工學、物性·分子工學 |
| 系統(tǒng)信息工學研究科 | 社會系統(tǒng)工學、經(jīng)營·政策科學、RISC工學、計算機科學、智能技能系統(tǒng)、構(gòu)造能源工學 |
| 生命環(huán)境工學研究科 | 地球科學、生物科學、生物資源科學、環(huán)境科學 |
| 人類綜合科學研究科 | 新領(lǐng)域醫(yī)科學、看護科學、感性認知腦科學、體育學、藝術(shù)、世界遺產(chǎn)、教育學 |
| 圖書館信息媒體研究課 | 圖書館信息媒體 |
博士課程研究科有：哲學·思想研究（哲學、倫理、宗教）、歷史·人類學（史學、文化人類學）、文藝·語言研究（文學、外國文學、語言學）、教育學（教育基礎(chǔ)、學校教育）、心理學、心身障礙學、社會科學（法學、經(jīng)濟學、社會學）、社會工程（計量計劃、經(jīng)營工程、城市地區(qū)規(guī)劃）、國際政治經(jīng)濟學、生物學（生物、生物物理化學）、數(shù)學、物理、化學、地球科學（地理水文、地質(zhì)）、工程學（物理工程、材料工程、結(jié)構(gòu)工程、電子信息工程）、醫(yī)學（形態(tài)學、生理、生化、生物、環(huán)境生態(tài)）、體育學、藝術(shù)學。
研究組織與教學組織分開，有學系、特別課題組和研究中心3種組織機構(gòu)。
學系
基本上以學科劃分，劃分原則為：學系不能太狹窄，盡可能地在相鄰學科領(lǐng)域中相互溝通，教員要能適應(yīng)全學系的研究，而且要向一定的學群和研究生院的研究科擔任教學任務(wù)，現(xiàn)共有26個學系：哲學·思想學、歷史·人類學、文藝·語言學、現(xiàn)代語言文學、教育學、心理學、心身障礙學、社會科學、社會工程、生物科學、農(nóng)村科學、農(nóng)林工程、應(yīng)用生物化學、數(shù)學、物理、化學、地球科學、物理工程、材料工程、結(jié)構(gòu)工程、電子·信息工程、體育科學、藝術(shù)科學、基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、社會醫(yī)學。
特別課題組
根據(jù)學術(shù)研究發(fā)展和社會需要設(shè)立，是跨學系的大型綜合、學科交叉的組織，不僅吸收校內(nèi)有關(guān)學系的教員，還向國內(nèi)外招收客員教授。特別課題組不是固定不變的組織機構(gòu)，在一定時期（一般為5年）內(nèi)當任務(wù)完成后即行解散，再根據(jù)新的研究課題而重新組織新的特別課題組，目前有3個課題組：①新國際系統(tǒng)研究課課組，研究課題有全球政治、經(jīng)濟有全球政治、經(jīng)濟、安全保障等；亞洲、太平洋區(qū)域政治、經(jīng)濟、安全保障；國際大系統(tǒng)的形成與日本的作用。②代謝研究課題組，課題有細胞間信息傳遞問題研究；生物體代謝可見性有關(guān)問題；循環(huán)代謝的異同研究。③循環(huán)器官的生物系統(tǒng)課題組，課題有：未知生物機能因子及其機能，生物機能因子與其受體的細胞內(nèi)信息傳遞，生物機能因子的循環(huán)防治機制及其異同，由遺傳因子導入的生物機能因子的解析等。
國民體質(zhì)研究，原子核特性特征，拉丁美洲研究，運動方法研究，熱帶農(nóng)村資源，生物體老化研究，生物本能的研究，物質(zhì)進化研究，變換技術(shù)開發(fā)等9個課題組因研究任務(wù)完成而解散。
為鼓勵個人研究、數(shù)人聯(lián)合的共同研究、特別是鼓勵青年研究人員的研究熱情，學校決定重點投資，設(shè)立研究經(jīng)費基金，促進派進學校學術(shù)研究的開展。從1989年開始設(shè)立特別贊助研究項目以來，獲得了國際上的高度評價。至今，各種資助項目的申請有822件，采納了374件，資助的經(jīng)費已達27932萬日元。
目前，全校共有20個服務(wù)于教師、學生教學和科研的大型中心組織，它們是：計算物理學、外語、體育、農(nóng)林技術(shù)、教學器械、加速器、低溫、學術(shù)信息處理、放射性同位素、分析、工作、水文物理實驗、動物實驗、下田臨海實驗、菅平高原實驗、天體研究、留學生、遺傳實驗、大學研究、質(zhì)子線醫(yī)學利用研究。另有理療科教師培訓機構(gòu)。