東京大學校區(qū)設(shè)在東京都內(nèi)文京區(qū)本鄉(xiāng)，占地面積40公頃 ，全校絕大部分機構(gòu)均在這里。另外在目黑區(qū)駒場另建一新校區(qū)，為教養(yǎng)學部及部分后勤設(shè)施所在地。附屬學校、工同研究部門，實驗實習基地（如農(nóng)場、林場、地震、火山、天文等觀察站）、師生員工宿舍等分布于全國各地。原校本區(qū)的舊校門棗紅門所在地，原為江戶時代藩主迎接家庭成員的地方，大門被漆成朱紅色。后經(jīng)東京大地震和二次大戰(zhàn)的破壞，1949年被國家定為重點文物。1991年重新修繕一新，十分有氣派，現(xiàn)紅門成為東京大學的代名詞。
國內(nèi)高校排名
全球高校網(wǎng)（4ICU）國家高校排名 第2位
奈杰爾·沃德（Nigelward）日本前30位大學排名 第1位
全球高校排名
美國《新聞周刊》世界100強大學排名 第16位
韋伯麥特里克斯網(wǎng)(Webometrics)世界大學排名第52位
法國巴黎高等礦業(yè)學院世界大學排名 第1位亞洲排名
QS亞洲大學排名
| 排名 | 大學院校 | 國家或地區(qū) | 得分 |
| 1 | 香港科技大學 | 中國香港 | 100.00 |
| 2 | 香港大學 | 中國香港 | 99.80 |
| 3 | 新加坡國立大學（NUS） | 新加坡 | 99.30 |
| 4 | 日本東京大學 | 日本 | 97.40 |
| 5 | 香港中文大學 | 中國香港 | 97.20 |
| 6 | 首爾大學 | 韓國 | 96.90 |
| 7 | 京都大學 | 日本 | 96.30 |
| 8 | 大阪大學 | 日本 | 96.10 |
| 9= | 東北大學 | 日本 | 94.30 |
| 9= | 日本東京工業(yè)大學 | 日本 | 94.30 |
| 11 | 韓國科學技術(shù)院 | 韓國 | 94.20 |
| 12 | 浦項科技大學 | 韓國 | 93.60 |
| 13 | 北京大學 | 中國 | 93.30 |
| 14 | 名古屋大學 | 日本 | 92.80 |
| 15 | 香港城市大學 | 中國香港 | 91.20 |
| 16 | 清華大學 | 中國 | 90.20 |
| 17 | 南洋理工大學（NTU） | 新加坡 | 89.40 |
| 18= | 九州大學 | 日本 | 86.90 |
| 18= | 延世大學 | 韓國 | 86.90 |
| 20 | 北海道大學 | 日本 | 85.80 |