1. 直屬局受理初審
1.1 申請單位資格和應(yīng)提供的初審材料
1.1.1 申請單位資格
申請單位應(yīng)當(dāng)是具有獨立法人資格并直接對外簽訂貿(mào)易合同或協(xié)議的單位。申請單位應(yīng)當(dāng)在對外簽訂合同或協(xié)議前，取得《進境動植物檢疫許可證》。
1.1.2 初審材料
申請單位按要求填寫《進境動植物檢疫許可證申請表》，并提交有關(guān)初審證明材料，到進境口岸或使用地的直屬檢驗檢疫局初審機構(gòu)辦理初審。有關(guān)證明材料應(yīng)包括：
1） 申請單位的法人資格證明文件（復(fù)印件）。
2） 同一申請單位再次申請時，應(yīng)附上一次《進境動植物檢疫許可證》（含核銷表）。
3） 因科學(xué)研究需要引進植物病原體（包括菌種、毒種）、害蟲及其他有害生物的，必須提交書面申請，詳細(xì)說明進口禁止進境物的用途、使用方式及管理措施，另外還應(yīng)提供科研立項報告及相關(guān)部門的批準(zhǔn)立項證明文件。
4） 申請進口轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的，申請初審時應(yīng)交驗農(nóng)業(yè)部頒發(fā)的農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全證書或進口轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品臨時證明原件（2003年9月20日前）。
5） 第一次進口植物栽培介質(zhì)的，需提供栽培介質(zhì)的來源、成份、生產(chǎn)工藝流程等的有關(guān)說明材料并由國外供貨商直接寄送樣品到國家質(zhì)檢總局動植物檢疫實驗所檢疫，樣品進境應(yīng)先辦理樣品的特許審批手續(xù)。
1.2 初審機關(guān)
1.2.1 對入境后不需要實施隔離檢疫和檢疫監(jiān)管的進境植物及其產(chǎn)品，如植物源性飼料添加劑在入境口岸直屬檢驗檢疫局初審。
1.2.2 進境煙草、植物栽培介質(zhì)、特許審批，由使用地直屬檢驗檢疫局初審并出具考核報告。
1.2.3 進境大豆、玉米、小麥、大麥、木薯（僅指未經(jīng)加工或經(jīng)初加工）、植物飼料等，由使用地直屬檢驗檢疫局出具對進境加工使用企業(yè)的考核報告，并經(jīng)入境口岸直屬檢驗檢疫局初審。
1.3 初審要求
1） 申請單位提交的材料是否齊全；進境栽培介質(zhì)要提交國家質(zhì)檢總局動植物檢疫實驗所出具的檢疫結(jié)果報告。
2） 輸出和途經(jīng)國家或者地區(qū)有無相關(guān)的動植物疫情。
3） 是否符合中國有關(guān)動植物檢疫法律法規(guī)和部門規(guī)章的規(guī)定。
4） 是否符合中國與輸出國家或者地區(qū)簽訂的雙邊檢疫協(xié)定（包括檢疫協(xié)議、議定書、備忘錄等）。
5） 進境后需要對生產(chǎn)、加工過程實施檢疫監(jiān)督的植物及其產(chǎn)品，審查其運輸、生產(chǎn)、加工、存放及處理等環(huán)節(jié)是否符合檢疫防疫及監(jiān)管條件，根據(jù)生產(chǎn)、加工企業(yè)的加工能力核定其進境數(shù)量。
6） 可以核銷的進境植物產(chǎn)品，應(yīng)當(dāng)按照有關(guān)規(guī)定審核其上一次審批的《進境動植物檢疫許可證》的使用、核銷情況。
1.4 上報國家質(zhì)檢總局審批
1） 初審合格的，由初審機構(gòu)簽署初審意見，并加蓋審批專用章。對需要實施檢疫監(jiān)管的進境植物產(chǎn)品，必要時出具對其生產(chǎn)加工存放單位的考核報告。由初審機構(gòu)將所有材料上報國家質(zhì)檢總局審核。
2） 初審不合格的，將申請材料退回申請單位。
2. 國家質(zhì)檢總局受理和簽發(fā)進境動植物檢疫許可證
國家質(zhì)檢總局根據(jù)審核情況，自收到初審機構(gòu)提交的初審材料之日起30個工作日內(nèi)簽發(fā)《進境動植物檢疫許可證》或者《進境動植物檢疫許可證申請未獲批準(zhǔn)通知單》。
3. 備案
引種單位、個人或其代理人應(yīng)在植物繁殖材料進境前10～15日，將《進境動植物檢疫許可證》或《引進種子、苗木檢疫審批單》送入境口岸直屬檢驗檢疫機構(gòu)辦理備案手續(xù)。
對不符合有關(guān)規(guī)定的檢疫審批單，直屬檢驗檢疫機構(gòu)可拒絕辦理備案手續(xù)。
4. 使用
4.1 申請單位在貨物進境時憑審批單或進境動植物檢疫許可證，在入境口岸檢驗檢疫局辦理報檢手續(xù)。
4.2 由直屬檢驗檢疫局簽發(fā)的旅客攜帶物、郵寄物檢疫許可證，申請人可直接到入境檢驗檢疫局辦理登記和報檢手續(xù)。
4.3 進口轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的，應(yīng)在報檢時提交進口轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品臨時證明（2003年9月20日前）或農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全證書（2003年9月20日后）和農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物標(biāo)識審查認(rèn)可批準(zhǔn)文件。
5. 報檢驗證
檢務(wù)工作人員在受理報檢時，應(yīng)仔細(xì)核對植物檢疫審批單證的有效性，申請單位與貿(mào)易合同的簽約方、收貨人應(yīng)一致，要特別核對貨物裝船日期是否在取得《進境動植物檢疫許可證》之后，如果貨物在取得進境動植物檢疫許可證之前裝船，應(yīng)不受理報檢。
6. 核銷
檢疫審批證單所批準(zhǔn)的數(shù)量需多次才能進完的，進境時需在入境口岸按審批要求核銷進口的數(shù)（重）量。進境核銷使用《進境動植物檢疫許可證》第一聯(lián)背面所附的核銷表或各直屬局印制的核銷表作核銷登記。
1） 核銷手續(xù)在入境口岸報檢和查驗時同時進行，必須由兩名檢驗檢疫工作人員在核銷表上簽字方為有效。受理報檢時，檢務(wù)人員作驗證核銷，在核銷表上簽名；現(xiàn)場查驗時，查驗人員作查驗核銷，報檢的數(shù)（重）量與實際的數(shù)（重）量相一致時，查驗人員在核銷表上簽名，核銷有效。否則應(yīng)當(dāng)重新報檢，重新核銷。
2） 用完進境動植物檢疫許可證背面所附的核銷表或直屬局核銷表但余有一定數(shù)量尚未進口的，且審批單在有效期內(nèi)的，貨主可憑審批單和用完的直屬局核銷表向檢驗檢疫機構(gòu)領(lǐng)取加頁。
3） 核銷表應(yīng)如實填寫，任何人不得涂改、變造或故意損毀核銷表。核銷表應(yīng)妥善保管，如遺失，應(yīng)先登報申明遺失的核銷表作廢，并出具單位證明和最近一次的報檢核銷記錄，向檢驗檢疫機構(gòu)申請補辦。
7. 重新辦理
有下列情況之一的，貨主或其代理人應(yīng)重新辦理進境動植物檢疫許可證或農(nóng)林部門審批單：
1） 變更入境貨物種類或超過許可數(shù)量的5%以上的，糧食和飼料數(shù)量超過10%的；
2） 變更輸出國家或地區(qū)的；
3） 變更入境口岸、指運地或者運輸路線的。
8. 依據(jù)
1） 1《中華人民共和國進出境動植物檢疫法》
2） 2《中華人民共和國進出境動植物檢疫法實施條例》
3） 3 《農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全管理條例》
4） 國家質(zhì)檢總局2002年第25號令《進境動植物檢疫審批管理辦法》
5） 國家質(zhì)檢總局2002年第2號公告(動植物檢疫審批名錄)
6） 國家質(zhì)檢總局2001年第7號局令 《出入境糧食和飼料檢驗檢疫管理辦法》
7） 國家檢驗檢疫局2000年第10號局令《進境植物繁殖材料檢疫管理辦法》
8） 國家檢驗檢疫局2000年第13號局令《進境栽培介質(zhì)檢疫管理辦法》
9） 農(nóng)業(yè)部《關(guān)于加強進口糧食檢疫有關(guān)問題的通知》（農(nóng)檢疫發(fā)[1996]9號）
10） 農(nóng)業(yè)部1997年第72號公告《中華人民共和國進境植物檢疫禁止進境物名錄》
11） 農(nóng)業(yè)部2001年第37號公告（允許加拿大烤煙對華出口）
12） 農(nóng)業(yè)部2001年第151號公告（允許美國煙葉對華出口）
13） 農(nóng)業(yè)部、國家檢驗檢疫局《關(guān)于進一步加強國外引種檢疫審批管理工作的通知》（農(nóng)農(nóng)發(fā)[1999]7號）
14） 國家檢驗檢疫局《關(guān)于同意有條件試進口意大利混配煙片的函》（國檢動函（2000）249號）
15） 國家質(zhì)檢總局《關(guān)于同意從法國摩迪公司進口中國煙草原料加工的煙草薄片的函》（國質(zhì)檢動函（2001）353號）
16） 國家質(zhì)檢總局《關(guān)于進境動植物檢疫審批有關(guān)問題的通知》（國質(zhì)檢動函[2002]559號）
17） 國家質(zhì)檢總局2003年第43號公告（取消8類植物產(chǎn)品審批）
1.1 申請單位資格和應(yīng)提供的初審材料
1.1.1 申請單位資格
申請單位應(yīng)當(dāng)是具有獨立法人資格并直接對外簽訂貿(mào)易合同或協(xié)議的單位。申請單位應(yīng)當(dāng)在對外簽訂合同或協(xié)議前，取得《進境動植物檢疫許可證》。
1.1.2 初審材料
申請單位按要求填寫《進境動植物檢疫許可證申請表》，并提交有關(guān)初審證明材料，到進境口岸或使用地的直屬檢驗檢疫局初審機構(gòu)辦理初審。有關(guān)證明材料應(yīng)包括：
1） 申請單位的法人資格證明文件（復(fù)印件）。
2） 同一申請單位再次申請時，應(yīng)附上一次《進境動植物檢疫許可證》（含核銷表）。
3） 因科學(xué)研究需要引進植物病原體（包括菌種、毒種）、害蟲及其他有害生物的，必須提交書面申請，詳細(xì)說明進口禁止進境物的用途、使用方式及管理措施，另外還應(yīng)提供科研立項報告及相關(guān)部門的批準(zhǔn)立項證明文件。
4） 申請進口轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的，申請初審時應(yīng)交驗農(nóng)業(yè)部頒發(fā)的農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全證書或進口轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品臨時證明原件（2003年9月20日前）。
5） 第一次進口植物栽培介質(zhì)的，需提供栽培介質(zhì)的來源、成份、生產(chǎn)工藝流程等的有關(guān)說明材料并由國外供貨商直接寄送樣品到國家質(zhì)檢總局動植物檢疫實驗所檢疫，樣品進境應(yīng)先辦理樣品的特許審批手續(xù)。
1.2 初審機關(guān)
1.2.1 對入境后不需要實施隔離檢疫和檢疫監(jiān)管的進境植物及其產(chǎn)品，如植物源性飼料添加劑在入境口岸直屬檢驗檢疫局初審。
1.2.2 進境煙草、植物栽培介質(zhì)、特許審批，由使用地直屬檢驗檢疫局初審并出具考核報告。
1.2.3 進境大豆、玉米、小麥、大麥、木薯（僅指未經(jīng)加工或經(jīng)初加工）、植物飼料等，由使用地直屬檢驗檢疫局出具對進境加工使用企業(yè)的考核報告，并經(jīng)入境口岸直屬檢驗檢疫局初審。
1.3 初審要求
1） 申請單位提交的材料是否齊全；進境栽培介質(zhì)要提交國家質(zhì)檢總局動植物檢疫實驗所出具的檢疫結(jié)果報告。
2） 輸出和途經(jīng)國家或者地區(qū)有無相關(guān)的動植物疫情。
3） 是否符合中國有關(guān)動植物檢疫法律法規(guī)和部門規(guī)章的規(guī)定。
4） 是否符合中國與輸出國家或者地區(qū)簽訂的雙邊檢疫協(xié)定（包括檢疫協(xié)議、議定書、備忘錄等）。
5） 進境后需要對生產(chǎn)、加工過程實施檢疫監(jiān)督的植物及其產(chǎn)品，審查其運輸、生產(chǎn)、加工、存放及處理等環(huán)節(jié)是否符合檢疫防疫及監(jiān)管條件，根據(jù)生產(chǎn)、加工企業(yè)的加工能力核定其進境數(shù)量。
6） 可以核銷的進境植物產(chǎn)品，應(yīng)當(dāng)按照有關(guān)規(guī)定審核其上一次審批的《進境動植物檢疫許可證》的使用、核銷情況。
1.4 上報國家質(zhì)檢總局審批
1） 初審合格的，由初審機構(gòu)簽署初審意見，并加蓋審批專用章。對需要實施檢疫監(jiān)管的進境植物產(chǎn)品，必要時出具對其生產(chǎn)加工存放單位的考核報告。由初審機構(gòu)將所有材料上報國家質(zhì)檢總局審核。
2） 初審不合格的，將申請材料退回申請單位。
2. 國家質(zhì)檢總局受理和簽發(fā)進境動植物檢疫許可證
國家質(zhì)檢總局根據(jù)審核情況，自收到初審機構(gòu)提交的初審材料之日起30個工作日內(nèi)簽發(fā)《進境動植物檢疫許可證》或者《進境動植物檢疫許可證申請未獲批準(zhǔn)通知單》。
3. 備案
引種單位、個人或其代理人應(yīng)在植物繁殖材料進境前10～15日，將《進境動植物檢疫許可證》或《引進種子、苗木檢疫審批單》送入境口岸直屬檢驗檢疫機構(gòu)辦理備案手續(xù)。
對不符合有關(guān)規(guī)定的檢疫審批單，直屬檢驗檢疫機構(gòu)可拒絕辦理備案手續(xù)。
4. 使用
4.1 申請單位在貨物進境時憑審批單或進境動植物檢疫許可證，在入境口岸檢驗檢疫局辦理報檢手續(xù)。
4.2 由直屬檢驗檢疫局簽發(fā)的旅客攜帶物、郵寄物檢疫許可證，申請人可直接到入境檢驗檢疫局辦理登記和報檢手續(xù)。
4.3 進口轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的，應(yīng)在報檢時提交進口轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品臨時證明（2003年9月20日前）或農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全證書（2003年9月20日后）和農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物標(biāo)識審查認(rèn)可批準(zhǔn)文件。
5. 報檢驗證
檢務(wù)工作人員在受理報檢時，應(yīng)仔細(xì)核對植物檢疫審批單證的有效性，申請單位與貿(mào)易合同的簽約方、收貨人應(yīng)一致，要特別核對貨物裝船日期是否在取得《進境動植物檢疫許可證》之后，如果貨物在取得進境動植物檢疫許可證之前裝船，應(yīng)不受理報檢。
6. 核銷
檢疫審批證單所批準(zhǔn)的數(shù)量需多次才能進完的，進境時需在入境口岸按審批要求核銷進口的數(shù)（重）量。進境核銷使用《進境動植物檢疫許可證》第一聯(lián)背面所附的核銷表或各直屬局印制的核銷表作核銷登記。
1） 核銷手續(xù)在入境口岸報檢和查驗時同時進行，必須由兩名檢驗檢疫工作人員在核銷表上簽字方為有效。受理報檢時，檢務(wù)人員作驗證核銷，在核銷表上簽名；現(xiàn)場查驗時，查驗人員作查驗核銷，報檢的數(shù)（重）量與實際的數(shù)（重）量相一致時，查驗人員在核銷表上簽名，核銷有效。否則應(yīng)當(dāng)重新報檢，重新核銷。
2） 用完進境動植物檢疫許可證背面所附的核銷表或直屬局核銷表但余有一定數(shù)量尚未進口的，且審批單在有效期內(nèi)的，貨主可憑審批單和用完的直屬局核銷表向檢驗檢疫機構(gòu)領(lǐng)取加頁。
3） 核銷表應(yīng)如實填寫，任何人不得涂改、變造或故意損毀核銷表。核銷表應(yīng)妥善保管，如遺失，應(yīng)先登報申明遺失的核銷表作廢，并出具單位證明和最近一次的報檢核銷記錄，向檢驗檢疫機構(gòu)申請補辦。
7. 重新辦理
有下列情況之一的，貨主或其代理人應(yīng)重新辦理進境動植物檢疫許可證或農(nóng)林部門審批單：
1） 變更入境貨物種類或超過許可數(shù)量的5%以上的，糧食和飼料數(shù)量超過10%的；
2） 變更輸出國家或地區(qū)的；
3） 變更入境口岸、指運地或者運輸路線的。
8. 依據(jù)
1） 1《中華人民共和國進出境動植物檢疫法》
2） 2《中華人民共和國進出境動植物檢疫法實施條例》
3） 3 《農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全管理條例》
4） 國家質(zhì)檢總局2002年第25號令《進境動植物檢疫審批管理辦法》
5） 國家質(zhì)檢總局2002年第2號公告(動植物檢疫審批名錄)
6） 國家質(zhì)檢總局2001年第7號局令 《出入境糧食和飼料檢驗檢疫管理辦法》
7） 國家檢驗檢疫局2000年第10號局令《進境植物繁殖材料檢疫管理辦法》
8） 國家檢驗檢疫局2000年第13號局令《進境栽培介質(zhì)檢疫管理辦法》
9） 農(nóng)業(yè)部《關(guān)于加強進口糧食檢疫有關(guān)問題的通知》（農(nóng)檢疫發(fā)[1996]9號）
10） 農(nóng)業(yè)部1997年第72號公告《中華人民共和國進境植物檢疫禁止進境物名錄》
11） 農(nóng)業(yè)部2001年第37號公告（允許加拿大烤煙對華出口）
12） 農(nóng)業(yè)部2001年第151號公告（允許美國煙葉對華出口）
13） 農(nóng)業(yè)部、國家檢驗檢疫局《關(guān)于進一步加強國外引種檢疫審批管理工作的通知》（農(nóng)農(nóng)發(fā)[1999]7號）
14） 國家檢驗檢疫局《關(guān)于同意有條件試進口意大利混配煙片的函》（國檢動函（2000）249號）
15） 國家質(zhì)檢總局《關(guān)于同意從法國摩迪公司進口中國煙草原料加工的煙草薄片的函》（國質(zhì)檢動函（2001）353號）
16） 國家質(zhì)檢總局《關(guān)于進境動植物檢疫審批有關(guān)問題的通知》（國質(zhì)檢動函[2002]559號）
17） 國家質(zhì)檢總局2003年第43號公告（取消8類植物產(chǎn)品審批）