財稅差異：根據(jù)《實施條例》第七十一條規(guī)定：長期股權投資計稅基礎=取得投資時資產(chǎn)的公允價值+支付的相關稅費。這里的相關稅金指的是價外稅增值稅，記入長期股權投資的初始成本，而價內(nèi)稅則記入“營業(yè)稅金及附加”科目。合并發(fā)生的審計費、評估費等直接相關費用也記入長期股權投資的初始成本，而不像同一控制下將其記入管理費用科目。
吸收合并
例：甲公司和乙公司不具有關聯(lián)關系。2008年12月1日，甲公司通過定向增發(fā)股票面值2000萬，公允價值6000萬元，并支付銀行存款100萬元，吸收合并己公司。其他條件與側2相同。
解析：非同一控制下的企業(yè)合并中，取得各項可辨認資產(chǎn)、負債的公允價值與其計稅基礎之間形成暫時性差異的，應確認相應的遞延所得稅資產(chǎn)和遞延所得稅負債，同時調整合并中應予確認的商譽，甲合并企業(yè)支付給被合并企業(yè)乙的非股權支付額100萬元，小于所支付的股權票面價值的20％(100／2000=5％)，稅務上作為免稅合并處理。稅法規(guī)定，被合并各項資產(chǎn)和負債應按原被合并企業(yè)賬面價值作為計稅基礎，所以計稅基礎為3000萬元，小于資產(chǎn)的賬面價值4000萬元，產(chǎn)生應納稅的暫時性差異1000萬元，確認遞廷所得稅負債250萬元。賬務處理為：
借：各項資產(chǎn) 4000 商譽 3150
貸：各項負債800 銀行存款 100 股本 2000
資本公積——資本溢價 4000 遞延所得稅負債250
商譽的處理
非同一控制下的企業(yè)合并中，因企業(yè)合并成本大于合并中取得的被購買方可辨認凈資產(chǎn)公允價值的份額，按照會計準則規(guī)定應確認為商譽，但按照稅法規(guī)定不允許確認商譽。即商譽的計稅基礎為0，商譽的賬面價值大于計稅基礎，兩者之閽的差額形成應納稅暫時性差異。因確認該遞廷所得稅負債會增加商譽的價值，若再考慮商譽產(chǎn)生的遞廷所得稅負債，則會進一步加大商譽的價值，從而又產(chǎn)生新絢商譽，如此循環(huán)，不可窮盡，所以，新準則規(guī)定，商譽產(chǎn)生的應納稅暫時性差異不確認遞延所得稅負債。
此外，關于企業(yè)合并中商譽的處理，主要應關往以下幾點：
商譽只產(chǎn)生在非同一控制下企業(yè)合并。商譽有兩個來源，在吸收合并時。商譽應記入購買方的賬內(nèi)，并反映在購買方個別資產(chǎn)負債表中；控股合并盼，商譽不做賬，包舍在長期股權授資賬面價值中，在編制合并報表時，反映在合并資產(chǎn)負債表中。
合并中發(fā)生的有關直接費用的處理：同一控制下企業(yè)合并過程中發(fā)生的各項直接相關、的費用，計入當期損益(管理費用)；非同一控制下，作為合并成本。
合并差額處理：周一控制下調整所有者權益(資本套積或盈余公積)，而非同一控制下確認“商譽”或計入“營業(yè)外收入”。
吸收合并
例：甲公司和乙公司不具有關聯(lián)關系。2008年12月1日，甲公司通過定向增發(fā)股票面值2000萬，公允價值6000萬元，并支付銀行存款100萬元，吸收合并己公司。其他條件與側2相同。
解析：非同一控制下的企業(yè)合并中，取得各項可辨認資產(chǎn)、負債的公允價值與其計稅基礎之間形成暫時性差異的，應確認相應的遞延所得稅資產(chǎn)和遞延所得稅負債，同時調整合并中應予確認的商譽，甲合并企業(yè)支付給被合并企業(yè)乙的非股權支付額100萬元，小于所支付的股權票面價值的20％(100／2000=5％)，稅務上作為免稅合并處理。稅法規(guī)定，被合并各項資產(chǎn)和負債應按原被合并企業(yè)賬面價值作為計稅基礎，所以計稅基礎為3000萬元，小于資產(chǎn)的賬面價值4000萬元，產(chǎn)生應納稅的暫時性差異1000萬元，確認遞廷所得稅負債250萬元。賬務處理為：
借：各項資產(chǎn) 4000 商譽 3150
貸：各項負債800 銀行存款 100 股本 2000
資本公積——資本溢價 4000 遞延所得稅負債250
商譽的處理
非同一控制下的企業(yè)合并中，因企業(yè)合并成本大于合并中取得的被購買方可辨認凈資產(chǎn)公允價值的份額，按照會計準則規(guī)定應確認為商譽，但按照稅法規(guī)定不允許確認商譽。即商譽的計稅基礎為0，商譽的賬面價值大于計稅基礎，兩者之閽的差額形成應納稅暫時性差異。因確認該遞廷所得稅負債會增加商譽的價值，若再考慮商譽產(chǎn)生的遞廷所得稅負債，則會進一步加大商譽的價值，從而又產(chǎn)生新絢商譽，如此循環(huán)，不可窮盡，所以，新準則規(guī)定，商譽產(chǎn)生的應納稅暫時性差異不確認遞延所得稅負債。
此外，關于企業(yè)合并中商譽的處理，主要應關往以下幾點：
商譽只產(chǎn)生在非同一控制下企業(yè)合并。商譽有兩個來源，在吸收合并時。商譽應記入購買方的賬內(nèi)，并反映在購買方個別資產(chǎn)負債表中；控股合并盼，商譽不做賬，包舍在長期股權授資賬面價值中，在編制合并報表時，反映在合并資產(chǎn)負債表中。
合并中發(fā)生的有關直接費用的處理：同一控制下企業(yè)合并過程中發(fā)生的各項直接相關、的費用，計入當期損益(管理費用)；非同一控制下，作為合并成本。
合并差額處理：周一控制下調整所有者權益(資本套積或盈余公積)，而非同一控制下確認“商譽”或計入“營業(yè)外收入”。